基本应对方法如下：
盾牌攻击炮开场先来两下
然后马上防守，防住两个护盾放出的冲击波
然后玩家们走到上面这条线（蜘蛛腿的上面两条腿的爪子要和地面上的那条直线重合），用冲击波+A连按，先打掉上面的护盾，基本上连那个球星机器人也会被同时打掉。第一下冲击波要追加A,第二下就没有必要了
然后走到下面，用一个冲击波+A追加，
然后马上到最下面的线躲过去Boss扔炸弹。于此同时顺便打坏下面的拉电绳的发电筒。
前面Boss出招的时候已经说过Boss扔炸弹的前兆了。三个玻璃罩的最里面的最后面的那个往天上扔出无数的小球子，而且有啵啵啵的响声的时候，玩家们就要马上撤到最下面的线了。
玩家们同时可以输入火箭弧形炮 ↓A ， 发射 3 排火箭向上或向下弧线跨越中间线。这样即使你在最下面，也能磨掉Boss一点血。然后在最下面的线直接按A就可以了。这样小型卫星出来的话，会往下方滑。玩家们注意打掉就行了
由于两个护盾被玩家们打掉了，所以Boss在没生成新的护盾之前，玩家们可以进行一段时间的尽情的攻击
然后接下来Boss会重新生成两个护盾，或者再放冲击波，又或者直接放出一个球星机器人发射激光。玩家们再重复上面的战略即可
等Boss的掉血超过一半的时候，他的出招会加速，所以玩家们要多存档练习，把这关弄熟练。
最后Boss万一启动了火焰炮，玩家们为了安全起见，就在最下面不停地用火箭弧形炮 ↓A 来磨掉Boss的一些血吧。
最终Boss只是一个纸老虎，只要多加练习，就不难过了。
罪魁首脑第二形态各角色单打困难指数：
布罗迪亚号：★★★（5星为难度最大）
雷普托斯号：★★★
古尔丁号：★★★
芬迪号：★★★
多打的话，难度更加降低不少了，因为有机身合体帮忙，能尽快弄掉Boss很多的体力